Category: животные

Category was added automatically. Read all entries about "животные".

В чем профит?

Cui prodest?



Продолжим об интересном: https://rusty-spur.livejournal.com/171131.html

А почему мы наблюдаем ленти и ретровирусы в геноме современных животных и человека? Значит те особи что интегрировали вирус в геном получили некие преимущества. А какие?

Вот статья (одна из): https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3758183/ нетерпеливые могут переходить сразу к главе 5:

Эндогенные ретровирусы могут (ERV) быть использоваться их хозяевами для регуляции генов, либо для трансляции специфических белков. Тканеспецифические энхансеры в ERV LTR являются примером контроля транскрипции.

Все млекопитающие экспрессируют амилазу в поджелудочной железе, но грызуны и приматы Старого Света также экспрессируют амилазу в слюнных железах. В обоих случаях элементы ERV играют роль в экспрессии слюны в удивительно конвергентной эволюции. Активация амилазы слюны в околоушной железе человека контролируется ретровирусной вставкой, которая произошла во время эволюции приматов Старого Света. Затем произошло трипликация гена амилазы и его энхансера LTR для дальнейшего усиления секреции амилазы после того, как гоминиды отделились от шимпанзе. Возможно, это обеспечило селективное преимущество линии гоминидов, когда они, подобно грызунам, приняли диету, содержащую сложные углеводы.

Преимущество экспрессии белков ERV для хозяина является наиболее значительным в эволюции плаценты млекопитающих. У различных отрядов плацентарных млекопитающих фузогенные свойства различных эндогенных ретровирусных гликопротеинов, называемых синцитинами, были превращены в физиологические преимущества для образования синцитиотрофобластов.

Гликопротеины ERV также могут быть полезны для блокирования рецепторов против экзогенной ретровирусной инфекции или против активированного реплицирующегося ERV. В качестве примера можно привести трансмиссивный ретровирус коалы, связанный с лейкемией. Интегрировавшись в геном, он может защитить коал от инфекции своим экзогенным, потенциально патогенным предшественником.

А про эволюцию нашей иммунной системы и возможные спекуляции по этому поводу, в следующей серии.

За что мы любим летучих мышей

Летучие мыши в последние годы привлекли внимание как важные резервуары вирусов, смертельных для человека и других млекопитающих. Эти инфекции, как правило, непатогенны у летучих мышей, что вызывает вопросы о различиях врожденного иммунитета, которые могут существовать между летучими мышами и другими млекопитающими. Семейство генов APOBEC3 кодирует антивирусные ДНК-цитозиндезаминазы, играющие важную роль в подавлении различных вирусов и геномных паразитов. Здесь мы охарактеризуем гены APOBEC3 летучих мышей и покажем, что виды в пределах этого рода обладают самым большим и самым разнообразным набором генов APOBEC3, идентифицированных у любого млекопитающего, о котором сообщалось на сегодняшний день. Некоторые белки APOBEC3 летучей мыши являются противовирусными, что продемонстрировано ограничением инфекционности ретровирусов с использованием ВИЧ-1 в качестве модели, а рекомбинантные подтипы A3Z1 обладают сильной ДНК-дезаминазной активностью. Эти гены представляют собой первую группу антивирусных факторов рестрикции, идентифицированных у летучих мышей, с обширным разнообразием по сравнению с гомологами у других млекопитающих.

https://academic.oup.com/mbe/article/35/7/1626/4956644



Обратите внимание на лошадь и приматов.

Эволюция лентивирусов

Очень хороший обзор: Viral evolution in deep time: lentiviruses and mammals https://doi.org/10.1016/j.tig.2011.11.003

Лентивирусы представляют собой особый род ретровирусов, вызывающих хронические стойкие инфекции у млекопитающих, включая человека. Появление пандемической инфекции ВИЧ в конце 20 века сформировало представление о лентивирусах как о «современных» вирусах. Однако недавние исследования выявили совершенно иную точку зрения, прояснив аспекты эволюционных отношений с млекопитающими, которые охватывают многие миллионы лет.

Collapse )

Корень лентивирусного дерева остается неопределенным. Хотя заманчиво предположить, что RELIK и вирус инфекционной анемии лошадей (EIAV) являются базальными вирусами, поскольку оба имеют относительно простые структуры генома без гена фактора инфекционности вириона (vif). Следует отметить, что потеря гена также могла произойти позже.

Ну и как же не коснуться зверюшки 20 года, летучей мыши?

Молодые и эффективные

или почему обезьяна дороже человека

https://verola.livejournal.com/1433188.html



Мы не будем даже говорить про принципиально новые подходы при сертификации вакцин (да и где они, в грядушем). Но отчего не начать нарабатывать вакцину до испытаний на людях, или начать олновременно in vitro и в животных.

Да и вопрос со звездочкой (*): Где вакцины от SARS и MERS?

Эволюционная гонка



APOBEC3 (A3) ферменты редактирования мРНК аполипопротеина B, каталитические полипептидоподобные являются специфическими для млекопитающих клеточными дезаминазами и обладают устойчивой способностью сдерживать репликацию лентивирусов. Чтобы противодействовать APOBEC3-опосредованному противовирусному действию, лентивирусы приобрели вирусный фактор инфекционности (Vif) в качестве дополнительного гена. Белки APOBEC3 млекопитающих ингибируют репликацию лентивирусов путем ферментативной вставки гипермутаций гуанина в аденин в вирусный геном, тогда как белки Vif лентивируса разрушают APOBEC3 хозяина через убиквитин / протеасомозависимый путь. Недавние исследования предоставляют доказательства того, что лентивирусные гены vif эволюционировали для борьбы с белками APOBEC3 млекопитающих. Как следствие, гены APOBEC3 млекопитающих находятся под дарвиновским избирательным давлением, чтобы избежать антагонизма со стороны Vif. На основании этих наблюдений широко признано, что лентивирус Vif и APOBEC3 млекопитающих эволюционировали совместно, и эта концепция называется «эволюционной гонкой вооружений». В этом обзоре дается исчерпывающий обзор текущих знаний об эволюционной динамике, происходящей в этом ключевом интерфейсе вирус-хозяин.

Collapse )

COVID-19 и датские норки



Анализ показал, что мутации, вероятно, не поставят под угрозу вакцины, но ученые говорят, что безудержное распространение означает, что животных нужно забить.
...
Похоже, что мутация cluster-5 - тупиковая в людях.

Статья в Nature: https://www.nature.com/articles/d41586-020-03218-z

Пресс релиз МЭБ о коронавирусе и норках



https://www.oie.int/en/scientific-expertise/specific-information-and-recommendations/questions-and-answers-on-2019novel-coronavirus/oies-response/

МЭБ признает, что такие события могут иметь важные последствия для общественного здравоохранения. Хотя пандемия COVID-19 в настоящее время поддерживается за счет передачи вируса от человека к человеку, существуют опасения, что внедрение и циркуляция новых штаммов вируса у людей может привести к изменению трансмиссивности или вирулентности, а также снижению эффективности лечения и вакцинации. Тем не менее, последствия остаются неизвестными, и необходимы дальнейшие исследования, чтобы полностью понять влияние этих мутаций.

Что же предлагается?
* Предотвращения передачи COVID-19 от людей к восприимчивым животным
* Мониторинг восприимчивых животных
* Сообщать о случаях заболевания животных в МЭБ
* Делиться геномами COVID-19, выделенными от животных

Если вы не хотите лечить меньших братьев будете бороться с эпидемиями

Народ, не желающий кормить свою армию, вскоре будет вынужден кормить чужую.
(на правах спекуляции)

Если мы не хотим разбираться с инфекциями животных, нам придется разбираться с ними в виде эпидемий и пандемий.

Буквально три примера:

1) ИНАН, ну это же только у лошадей, говорили они. Не лечится как то, говорили они. Ну мы введем карантин, тесты, особые анемичные хозяйства, да конину можно делать! Потом человек получил вирус из того же семейства. Да мы разберемся за три года, говорили они. Определенные успехи в терапии ВИЧ конечно есть. Скоро 40 лет отмечать будем.

2) Коронавирусы фигня, говорили они, вызывают лекгую простуду. Кошкам просто не повезло, говорили они. Ну подумаешь не лечится, не у каждой же кошки. Ну каков процент этих, с инфекционным периотонитом, спрашивали они. Вот и теперь как наука двинулась, как кошку ошпарили.

3) Африканская чума свиней. Ну да, экономически опасно, соглашались они. Зачем лечить, у нас есть напалм, говорили они. Человеку же не передается, утверждали они. Да и вообще, свинья - харам!
https://jvi.asm.org/content/83/24/13019
https://www.researchgate.net/publication/330714657_DNA_segments_of_African_Swine_Fever_Virus_detected_for_the_first_time_in_hard_ticks_from_sheep_and_bovines
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7036316/